Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORAP35398 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORAP35398 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RORAP35398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORAP35398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORAP35398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORAP35398 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RORAP35398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RORAP35398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RORAP35398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RORAP35398 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORAP35398 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORAP35398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORAP35398 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms