Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFC1P35251 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFC1P35251 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC1P35251 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC1P35251 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC1P35251 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC1P35251 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC1P35251 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC1P35251 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC1P35251 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC1P35251 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC1P35251 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC1P35251 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC1P35251 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC1P35251 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC1P35251 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms