Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDXP35241 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RDXP35241 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDXP35241 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDXP35241 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDXP35241 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDXP35241 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDXP35241 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDXP35241 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDXP35241 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RDXP35241 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDXP35241 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms