Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P33897 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms