Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX2P32243 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTX2P32243 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX2P32243 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX2P32243 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX2P32243 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX2P32243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX2P32243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX2P32243 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX2P32243 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX2P32243 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX2P32243 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX2P32243 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX2P32243 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms