Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIBADHP31937 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIBADHP31937 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIBADHP31937 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms