Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCSK6P29122 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK6P29122 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms