Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1P29120 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1P29120 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms