Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB3P28472 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.2 ms