Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN3P26045 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.9 ms