Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPH2P23942 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms