Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA1P21709 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms