Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms