Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKB1P19838 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms