Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2EP19388 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms