Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GM2AP17900 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GM2AP17900 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GM2AP17900 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GM2AP17900 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GM2AP17900 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GM2AP17900 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GM2AP17900 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GM2AP17900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GM2AP17900 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GM2AP17900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GM2AP17900 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GM2AP17900 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GM2AP17900 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GM2AP17900 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms