Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XBP1P17861 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XBP1P17861 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XBP1P17861 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XBP1P17861 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XBP1P17861 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XBP1P17861 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XBP1P17861 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XBP1P17861 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XBP1P17861 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XBP1P17861 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XBP1P17861 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XBP1P17861 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XBP1P17861 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XBP1P17861 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
XBP1P17861 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XBP1P17861 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XBP1P17861 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XBP1P17861 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XBP1P17861 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XBP1P17861 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XBP1P17861 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XBP1P17861 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XBP1P17861 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XBP1P17861 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XBP1P17861 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XBP1P17861 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XBP1P17861 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XBP1P17861 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XBP1P17861 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XBP1P17861 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XBP1P17861 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XBP1P17861 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XBP1P17861 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms