Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN2P17706 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN2P17706 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN2P17706 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms