Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYN1P17600 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYN1P17600 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYN1P17600 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYN1P17600 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYN1P17600 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYN1P17600 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYN1P17600 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYN1P17600 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYN1P17600 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYN1P17600 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYN1P17600 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYN1P17600 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYN1P17600 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYN1P17600 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYN1P17600 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYN1P17600 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYN1P17600 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYN1P17600 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYN1P17600 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYN1P17600 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYN1P17600 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYN1P17600 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms