Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1P17174 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1P17174 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1P17174 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1P17174 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1P17174 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOT1P17174 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOT1P17174 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOT1P17174 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOT1P17174 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOT1P17174 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOT1P17174 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOT1P17174 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOT1P17174 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOT1P17174 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOT1P17174 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOT1P17174 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOT1P17174 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOT1P17174 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOT1P17174 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOT1P17174 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOT1P17174 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOT1P17174 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOT1P17174 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOT1P17174 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOT1P17174 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GOT1P17174 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOT1P17174 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOT1P17174 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOT1P17174 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOT1P17174 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms