Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA3P15088 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA3P15088 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA3P15088 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA3P15088 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA3P15088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA3P15088 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA3P15088 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA3P15088 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA3P15088 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA3P15088 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA3P15088 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA3P15088 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.8 ms