Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM1P13688 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms