Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT13P13646 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT13P13646 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT13P13646 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT13P13646 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT13P13646 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT13P13646 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT13P13646 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT13P13646 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT13P13646 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT13P13646 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT13P13646 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT13P13646 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT13P13646 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT13P13646 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT13P13646 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT13P13646 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT13P13646 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT13P13646 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT13P13646 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT13P13646 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT13P13646 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT13P13646 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT13P13646 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT13P13646 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT13P13646 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT13P13646 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT13P13646 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms