Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RLBP1P12271 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLBP1P12271 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms