Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX6A1P12074 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms