Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYGBP11216 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYGBP11216 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PYGBP11216 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PYGBP11216 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYGBP11216 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYGBP11216 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYGBP11216 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYGBP11216 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYGBP11216 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYGBP11216 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYGBP11216 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYGBP11216 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYGBP11216 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms