Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSAP10619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSAP10619 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSAP10619 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSAP10619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSAP10619 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSAP10619 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSAP10619 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSAP10619 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSAP10619 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSAP10619 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSAP10619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSAP10619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSAP10619 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSAP10619 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSAP10619 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms