Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK3P0C264 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SBK3P0C264 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SBK3P0C264 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms