Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTAP09496 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTAP09496 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLTAP09496 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTAP09496 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLTAP09496 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLTAP09496 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTAP09496 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTAP09496 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTAP09496 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTAP09496 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTAP09496 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTAP09496 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTAP09496 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTAP09496 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTAP09496 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTAP09496 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTAP09496 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTAP09496 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTAP09496 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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