Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8AP07357 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8AP07357 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8AP07357 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8AP07357 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8AP07357 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8AP07357 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8AP07357 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8AP07357 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8AP07357 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8AP07357 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8AP07357 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8AP07357 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C8AP07357 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8AP07357 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8AP07357 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8AP07357 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8AP07357 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8AP07357 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8AP07357 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8AP07357 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8AP07357 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8AP07357 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8AP07357 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8AP07357 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms