Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOD2P04179 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOD2P04179 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOD2P04179 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOD2P04179 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD2P04179 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD2P04179 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD2P04179 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD2P04179 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD2P04179 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOD2P04179 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOD2P04179 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOD2P04179 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD2P04179 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD2P04179 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD2P04179 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms