Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1RP00736 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C1RP00736 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1RP00736 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1RP00736 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1RP00736 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1RP00736 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1RP00736 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1RP00736 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1RP00736 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1RP00736 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1RP00736 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1RP00736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1RP00736 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1RP00736 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1RP00736 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1RP00736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1RP00736 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1RP00736 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1RP00736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1RP00736 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1RP00736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1RP00736 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms