Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EGFRP00533 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EGFRP00533 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EGFRP00533 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EGFRP00533 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EGFRP00533 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EGFRP00533 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EGFRP00533 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EGFRP00533 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EGFRP00533 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EGFRP00533 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EGFRP00533 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EGFRP00533 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EGFRP00533 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EGFRP00533 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EGFRP00533 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EGFRP00533 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EGFRP00533 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EGFRP00533 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EGFRP00533 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EGFRP00533 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EGFRP00533 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EGFRP00533 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EGFRP00533 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EGFRP00533 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EGFRP00533 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EGFRP00533 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
EGFRP00533 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EGFRP00533 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EGFRP00533 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms