Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHEK2O96017 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms