Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSL3O95573 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms