Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN7O95471 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms