Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRATO95237 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRATO95237 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRATO95237 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRATO95237 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRATO95237 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRATO95237 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRATO95237 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRATO95237 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRATO95237 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRATO95237 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRATO95237 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRATO95237 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRATO95237 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms