Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3DO95025 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3DO95025 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms