Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOBTB3O94955 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms