Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BBOX1O75936 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms