Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS26AO75436 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms