Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22BO75396 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms