Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN1O60635 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPAN1O60635 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms