Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MGRN1O60291 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGRN1O60291 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms