Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFDO43915 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VEGFDO43915 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms