Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDIL3O43854 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms