Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOPO43791 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOPO43791 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOPO43791 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOPO43791 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOPO43791 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOPO43791 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOPO43791 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOPO43791 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOPO43791 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOPO43791 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOPO43791 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPOPO43791 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOPO43791 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms