Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH3O43739 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYTH3O43739 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYTH3O43739 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms