Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms