Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COCHO43405 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COCHO43405 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COCHO43405 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COCHO43405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COCHO43405 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COCHO43405 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
COCHO43405 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COCHO43405 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COCHO43405 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COCHO43405 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COCHO43405 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms